そのエクスポートは、アウトルック等へのエクスポートのはずです？？
アカウントなどはエクスポートでお好みのところに保存できますが・・
それより、必要なメールを好きなところにフォルダを作成し、
保存して、.emlファイルをフラッシュメモリー移したほうが楽かも・・。
新しいＰＣの受信フォルダ（保存フォルダ等）にドラッグ＆ドロップでいいんじゃないでしょうか・・。
いっぱいメールがあってもフォルダを開いて全て選択してドロップすれば
いいと思います。作業は重いですけれど・・面倒ですけれど・・。

旧パソコンのこれまでのメールの保存先は、下記�Aのフォルダです。このフォルダをどこかにバックアップしておいて、新パソコンの同じ場所にコピーすれば、新パソコンでこれまでのメールを引き継ぐことができます。但し、このフォルダを見つけるためには、下記�@を先ず実行してからでないと見つかりません。又、�@の実行が終わったら、�@を元に戻すこともお忘れなく。

�@すべてのフォルダを表示させる（スタートを右クリック->エクスプローラをクリック->ツールをクリック->フォルダオプションをクリック->表示をクリック->ファイルとフォルダの表示で「すべてのフォルダとファイルを表示する」を選択）
�Aこれまでのメールの保存フォルダ（ローカルディスク(通常Cが多い):\Documents and Settings\ユーザーの名前\Local Settings\Application Data\Identities\{特定の番号}\Microsoft\Outlook Express）

蛇足ですが、問題が解決した場合は、解決と評価をお願いします。それぞれの回答にお礼を言う手間も省けますよ。
http://www.kotaete-net.net/Docs.aspx?docname=QST4

/2，/3
大量に誤解をしているようなので指摘させていただきます。
>下記�Aのフォルダです。
いいえ。ユーザーが能動的に指定すれば、その場所ではなくなりますので、OE上の「オプション」経由でたどれる「保存フォルダ」から確認しなくてはなりません。

>このフォルダをどこかにバックアップしておいて、新パソコンの同じ場所にコピーすれば
いいえ。同じ場所にする必要はまったくありません。別ドライブでもかまいません。

>下記�@を先ず実行してからでないと見つかりません
いいえ。直接フルパスを指定してWindowsエクスプローラを開けば見ることができます。

丸数字は御法度です。

このサイトでは丸数字文字は御法度です。
http://www.kotaete-net.net/Default.aspx?pgid=104

OutlookExpressバックアップ&リストア↓の手順通りにやってみましょう。
http://homepage2.nifty.com/winfaq/c/oetips.html#260