2009年4月7日3時1分
男の行動に捜査の焦点が絞られるなかで、府警は男を昨年11月15日、同年7月と8月に、女性の下着や神社のさい銭約2千円を盗んだ容疑で逮捕した。その後、男の弁護人の立ち会いのもと、殺人・死体遺棄容疑で男の自宅の捜索・検証に乗り出した。捜索は11月28日から6日間、計約40時間に及び、男の衣服や手袋、自転車など約2千点を押収したが、男と殺害事件とを結びつける直接的な物証は見つからなかったとみられる。
男は今年2月25日、京都地裁舞鶴支部で懲役1年の判決を受け、確定した。現在は京都刑務所(京都市山科区)で服役している。
捜査本部は複数の状況証拠から、男が事件当夜、小杉さんと一緒に歩いていたことは確実視しているが、男は窃盗容疑で逮捕される前、朝日新聞記者の取材に対し、小杉さんとの面識について「全然、知らん」と否定し、事件当夜については「病気やから寝ていた」などと話していた。