| ステージ名 | 区分 | 出現条件 | クリア後 |
| かみポンの帰還 | オープニング | 最初のステージ | 消滅 |
| トッチラ海岸で狩りをしよう | 狩り | 初期出現 | 狩りステージとして残る |
| じゃじゃジャングルを探索せよ | カーメン戦 |
トッチラ海岸で狩りをしよう をクリア |
トレーニング：障害物を壊しゴールを目指せに変化 |
| 運命ナンジャロ丘の出会い | イベント |
じゃじゃジャングルを探索せよ をクリア |
トレーニング：攻撃と防御の練習に変化 |
| マテールの芽を守るもの | ボス戦(ドドンガ) |
運命ナンジャロ丘の出会い をクリア |
ドンガラ遺跡の巨竜ドドンガに変化 (天候が晴れの日) |
| 濃霧発生!!不屈の恐竜現る | ボス戦(マジドンガ) | ドンガラ遺跡が霧の日 |
不屈の巨竜マジドンガに変化 (天候が霧の日のみ) |
| 究極の巨竜 あらわるッ!! | ボス戦(カッチンドンガ) | ドンガラ遺跡が雪の日 |
凍てつく吐息カッチンドンガに変化 (天候が雪の日のみ) |
| ウッソー森のカーメン砦攻略戦 | カーメン戦 |
マテールの芽を守るもの をクリア |
数ステージクリア後(日数経過後？) ウッソー森のカーメン砦に変化 |
| その漢 二度死す | カーメン戦 |
ウッソー森のカーメン砦攻略戦 をクリア |
狩りステージキノコにょきにょきニョキリ沼に変化 |
| モッチチの逆襲 | ボス戦(モーチッチチ) |
その漢 二度死す をクリア |
怒れる巨鳥モーチッチチに変化 |
| ゴーンの試練 | ミラクル説明 |
モッチチの逆襲 をクリア |
消滅 |
| 原野の秘境ダチュラ遺跡の守護者 | ボス戦(ダラチュラ) |
岩山を覆う魔性の霧で ドバットから泥まみれの地図を入手 |
恐怖の串刺し怪獣ダラチュラに変化 |
| よこしまな見えざる手 | ボス戦(センチュラ) |
ゴーンの試練 をクリア |
霧に身を隠す怪物センチュラに変化 |
| 決戦!ゴンロック山 | カーメン戦 |
よこしまな見えざる手 をクリア |
狩りステージ岩山を覆う魔性の霧に変化 |
| 剣が峰エッジッジ断崖の要塞 | カーメン戦 |
決戦!ゴンロック山 をクリア |
数ステージクリア後(日数経過後？)復活 |
| ジゴトン投石機を奪還せよ! | 投石機奪還 | 超絶望で敗北 | |
| ネオガイン遺跡の覚醒 | ボス戦(ドガイン) |
ブリュン雪原に泣く子羊と母の怒りで ペッコラコからあかない箱を入手 |
自然力の巨神ドガインに変化します。 |
| 雲魔人フアラマタラの護る空 | カーメン戦 |
剣が峰エッジッジ断崖の要塞 をクリア |
消滅 |
| 神の住まう空の城 | カーメン戦 |
雲魔人フアラマタラの護る空 をクリア |
消滅 |
| 監視塔とふたりのカーメン | カーメン戦 |
神の住まう空の城 をクリア |
狩りステージブリュン雪原に泣く子羊と母の怒りに変化 |
| 盾の神将ノーメン | 投石機破壊 | 消滅 | |
| 大氷壁の突貫大作戦 | カーメン戦 | 数ステージクリア後(日数経過後？)復活 | |
| 凍りついた古代生物マンボスを倒せ | ボス戦(マンボス) | コチカチ湖の巨象マンボスに変化 | |
| マンボー遺跡に尖る原始の牙 | ボス戦(マンボロス) | キラリ星と黒い星でくろい星を入手 | 現存する最古の守護者マンボロスに変化 |
| キラリ星と黒い星 | イベント | 消滅 | |
| 冥界の門がひらく記憶 | カーメン戦 |
数ステージクリア後(日数経過後？) 魔宮門バババーンの死闘に変化 |
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| 始まりの爆心地 | カーメン戦 | 消滅 | |
| 灰色の虹と裏の顔 | ボス戦(ズッタタカーメン) | デッタンカーメンLv3から灰色の虹を入手 | 裏仮面の大悪魔ズッタンカーメンに変化 |
| セカイのヘソに立つ邪心 | ボス戦(ガルル) | 始まりの爆心地クリア | 冥界の従者ガルルに変化 |
| 火吹き山メララの不死鳥 | ボス戦(フェニッチ) | 火の鳥フェニッチに変化 | |
| コラアカン熱砂を越えて | カーメン戦 | 火吹き山メララの不死鳥クリア | モアカン熱砂の巨大生物をクリアしたら、狩りステージ砂漠をけむらす嵐のナゾはに変化 |
| 槍の神将キーメン | |||
| お約束か!?メデン誘拐!! | メデン救出 | 消滅 | |
| コラアカン熱砂の巨大生物 | ボス戦(ザックネル) | 砂漠の王ザックネルに変化 | |
| えっこらオアシス大争奪戦 | カーメン戦 | 数ステージクリア後(日数経過後？)復活 | |
| 仮面の国と三神将 | カーメン戦 | ||
| めっちゃくジャングルの守護者 | ボス戦(シュクル) | パタポン食い植物に変化 | |
| クネクネールを守る者 | ボス戦(ドカクネル) | 杖の神将フックメンにてしかくい車輪を入手 | 大いなるドカクネルに変化 |
| ググチョッパ遺跡の怒れる爪 | ボス戦(チョッキング) | 灼熱の爪チョッキングに変化 | |
| 超絶望 | イベント | ||
| 超希望への放物線 | カーメン戦 | 真・超希望への放物線に変化 | |
| 真・超兵器生ける要塞との戦い | ボス戦(ギャノディアス) |
冥界戦車ズガガング改Lv3から やわらかい石版を入手 |
生ける機動要塞ギャノディアスに変化 |
| ブラックほしポンよ永遠に | カーメン戦 |
数ステージクリア後(日数経過後？) 冥界戦車ズガガンク改に変化 |
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| Once UPON a TIme PATA-Pole | ボス戦(オーメンカーメン) | 消滅 | |
| パタポンを滅亡させた大悪魔 | ボス戦(デッタンカーメン) | 呪いの仮面の大悪魔デッタンカーメンに変化 |