今度こそメリッサとジム戦をするため、再びヨスガシティにやってきたサトシたち。すると突然"ドンッッ！！"と見知らぬトレーナーがぶつかってきた！だが、そのトレーナーはぶつかったことを悪びれもせず「なんだってんだよー！」とわめき散らして走り去ってしまった。一瞬あっけにとられるも「目的はジム戦！」と、気合を入れ直したサトシたちだったが、またしてもお預け！度重なる足止めにガッカリしながら歩いていると、そこに再び"ドンッッ！！"と衝突！顔を上げると見覚えのある姿が。彼の名前はジュン。どうやらパートナーのエンペルトと共に世界最強のトレーナーを目指しているようだ。しかも憧れの存在はシンジだって！？サトシは一体どうするの！？