自由党は平成１５年９月２６日の解党の２日前、合併相手の民主党からなぜか２億９５４０万円もの寄付を受けた一方、解党当日には、改革国民会議に１３億６８１６万円を寄付している。このため、国会で「政党助成金の返還逃れではないか」（故松岡利勝元農水相）と追及されたこともあり、“疑惑”は消えていない。