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小ネタ †
- モレントリー急行の食堂車両にいる人物達（ガーボンとドロシー・ローラ夫人・ウェイターの三人は除く）は、各問題に登場する人たち。
- 靴マークで移動するとき、いつもと違う音がしたら、その場所から出るには、別の矢印の方向じゃないと出られない場合がある。
- 発見されずにナゾーバ送りになったナゾのナゾのばしょは「迷子のナゾ部屋」となってしまう。
- ひらめきコインの獲得枚数が増えてくると、その横に表示されるコインの山も徐々に大きくなる
- 1枚〜30枚：コイン1個
- 31枚〜50枚：コインの山
- 51枚〜80枚：積み上げられたコイン
- 81枚〜149枚：袋詰めされたコイン
- 150枚〜229枚：王冠をかぶったレイトン
- 230枚：王冠をかぶったルーク
- 本編のナゾ138問全てクリアするとセーブデータのアイコンがレイトンからルークに変わる
- ある条件を満たすことによってセーブデータのアイコンがルークから○○に変わる
バグ †
- 人に話しかけて画面が切り替わるところでブラックアウト。(再現性なし)
再起動したところROMを読み込まなかったのでロードしようとしたら読み込むところがなかった、ということだろうか
- 「あとでとく」を選択したら戻らずフリーズ(再現性なし)
- ナゾ124の場所は「薄暗い路地」だが、ナゾじてんでは「路地の奥」と間違っている。（ちなみに、「路地の奥」は、前作での登場。）
- ナゾ137 「真実の剣」後の音声ありの会話中、音声が重なって聞こえてフリーズ。何度やっても同じ。
- ひらがな数文字の暗号のヒントの3番目の説明が1番目になってる。
- 「小部屋」の床のシミを調べたときのレイトンの台詞で「後」→「跡」の誤字？