　４日午後３時２０分ごろ、佐賀市本庄町本庄の本庄小（秀島芳博校長、５８１人）で、竜巻とみられる突風のため、同校のプールから「プールフロア」と呼ばれるプラスチック製の台（縦２メートル、横１メートル、高さ０・４メートル、重さ約３０キロ）が舞い上がり、約８メートル離れた体育館の地上約８メートルの場所にある窓ガラス１枚（縦１メートル、横０・７メートル、厚さ４ミリ）を直撃。割れたガラスの破片が飛び散り、館内にいた児童のうち３、４、６年生の男女６人が額や手足に軽いけがをした。

　市教委や佐賀県警などによると、体育館では文化庁の舞台芸術体験事業の一環で、大阪フィルハーモニー交響楽団の公演が行われ、５年生を除く全校児童が集まっていた。窓ガラスは公演終了直後に割れたといい、児童の一部は体育館の外に出ていた。

　プールフロアは背の低い児童のためにプールに沈めて底上げをする道具で、水を抜いたプールの底に２基置かれていた。うち１基が飛ばされたという。

　また、同校から北東１０メートルと北東１２０メートルの場所にある２棟のビニールハウスのビニールも裂けていた。目撃者の話から、市教委は、同校の北東側から南西側に竜巻とみられる突風が通過したとみている。

　佐賀地方気象台によると、佐賀市内はこの日午後、気圧の谷の通過で大気が不安定な状態だった。市教委によると同校周辺では午後４時ごろ、パチンコ玉ほどのヒョウが降ったという。