matplotlibでジャーナルに投稿可能な図を作るためのメモ

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2017年01月18日に投稿

良い記事でなくてすみませんが、論文投稿前になって図を直す時いっつも忘れて苦労するのでメモしました。

そもそも図のサイズを指定

fig = plt.figure(figsize=(15,3))

図の内外にtextを入れる

相対比での座標指定

ax.annotate('Test', xy=(0, 1.1), xycoords='axes fraction', fontsize=16)

データ点での座標指定

ax.annotate('Test', xy=(0, 0.1), xycoords='data', fontsize=16)

x軸の数値のいらないところを消す。

ax.xaxis.set_ticklabels([])

tickも消す

ax.axes.get_xaxis().set_ticks([])

軸の数値の表記法を0.1, 0.5みたいにする

from matplotlib.ticker import MultipleLocator, FormatStrFormatter
ax.xaxis.set_major_formatter(FormatStrFormatter("%.1f"))

y軸の数字がながいとき

ax.yaxis.set_major_formatter(FormatStrFormatter("%1.e"))

軸の向きを逆転

plt.gca().invert_xaxis()

軸の数値を適宜拡大する

plt.tick_params(labelsize=20)

(データと無関係に)アスペクト比を変える。

この場合、plotのdata比を取得してから利用することが必要である。
すなわち、0.7の場合、ax.plotしてから

ax.set_aspect(0.7/ax.get_data_ratio())

カラーバーを水平につけてラベルを書く

cbar=colorbar(bar, orientation='horizontal')
cbar.set_label(‘color label',size=14)

カラーを対数でぬる

from matplotlib.colors import LogNorm
bar=ax.imshow(stdall,vmin=0.01,vmax=1.0,extent[w[0],w[-1],2250.0,6750.0],\
interpolation='nearest',cmap="hot",norm=LogNorm())

カラーバーのtickを追加する

 cbar=colorbar(bar, orientation='horizontal',ticks=\
[0.05,0.06,0.07,0.08,0.09,0.1,0.2,0.3,0.4,0.5,0.6,0.7,0.8,0.9,1.0])

カラーバーのサイズを図に合わせる

from mpl_toolkits.axes_grid1 import make_axes_locatable

divider = make_axes_locatable(ax)
cax = divider.append_axes("right", size="5%", pad=0.05)
plt.colorbar(a, cax=cax)

下のラベル字がはみださないようにする

fig.subplots_adjust(bottom=0.2)

変な余白やらラベルが切れたりするのを防いでPDF出力する。

plt.savefig("figure1.pdf", bbox_inches="tight", pad_inches=0.0)

良い記事でなくてすみませんが、論文投稿前になって図を直す時いっつも忘れて苦労するのでメモしました。

そもそも図のサイズを指定
------------------------

```
fig = plt.figure(figsize=(15,3))
```

図の内外にtextを入れる
--------------------------------
相対比での座標指定

```
ax.annotate('Test', xy=(0, 1.1), xycoords='axes fraction', fontsize=16)
```

データ点での座標指定

```
ax.annotate('Test', xy=(0, 0.1), xycoords='data', fontsize=16)
```

x軸の数値のいらないところを消す。
-----------------------------------------------------

```
ax.xaxis.set_ticklabels([])
```

tickも消す
--------------------------------

```
ax.axes.get_xaxis().set_ticks([])
```

軸の数値の表記法を0.1, 0.5みたいにする
---------------------------------------

```
from matplotlib.ticker import MultipleLocator, FormatStrFormatter
ax.xaxis.set_major_formatter(FormatStrFormatter("%.1f"))
```

y軸の数字がながいとき
--------------------------

```
ax.yaxis.set_major_formatter(FormatStrFormatter("%1.e"))
```

軸の向きを逆転
-------------------------------

```
plt.gca().invert_xaxis()
```

軸の数値を適宜拡大する
--------------------------------------------------

```
plt.tick_params(labelsize=20)
```

(データと無関係に)アスペクト比を変える。
----------------------------------

この場合、plotのdata比を取得してから利用することが必要である。
すなわち、0.7の場合、ax.plotしてから

```
ax.set_aspect(0.7/ax.get_data_ratio())
```

カラーバーを水平につけてラベルを書く
---------------------------------

```
cbar=colorbar(bar, orientation='horizontal')
cbar.set_label(‘color label',size=14)
```
![temp1.jpg](https://qiita-image-store.s3.amazonaws.com/0/137970/2089de82-d54e-8004-4a28-6ff829a001e7.jpeg)

カラーを対数でぬる
---------------------

```
from matplotlib.colors import LogNorm
bar=ax.imshow(stdall,vmin=0.01,vmax=1.0,extent[w[0],w[-1],2250.0,6750.0],\
interpolation='nearest',cmap="hot",norm=LogNorm())
```

![temp2.jpg](https://qiita-image-store.s3.amazonaws.com/0/137970/ed84c297-2b49-ab78-219e-36e70953aa0b.jpeg)

カラーバーのtickを追加する
---------------------------------

```
 cbar=colorbar(bar, orientation='horizontal',ticks=\
[0.05,0.06,0.07,0.08,0.09,0.1,0.2,0.3,0.4,0.5,0.6,0.7,0.8,0.9,1.0])
```

カラーバーのサイズを図に合わせる
-----------------------------

```
from mpl_toolkits.axes_grid1 import make_axes_locatable

divider = make_axes_locatable(ax)
cax = divider.append_axes("right", size="5%", pad=0.05)
plt.colorbar(a, cax=cax)
```

下のラベル字がはみださないようにする
----------------------------------

```
fig.subplots_adjust(bottom=0.2)
```

変な余白やらラベルが切れたりするのを防いでPDF出力する。
--------------------------------------------------

```
plt.savefig("figure1.pdf", bbox_inches="tight", pad_inches=0.0)
```

HajimeKawahara

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