基本的にその手順で間違っていないです。
僕が以前テストした時には、その手順で移行できました。

何かエラーとかでませんでした?

コツは、ドメインコントローラとしての機能のみを残して(IISとかDHCPはアンインストール)アップグレードするあたりですかね...

回答ありがとうございます。
ドメインコントローラ機能のみでアップグレードしていると思うのですが、再度確認しアップグレードして見ます。

コントロールパネルにも「管理ツール」はないのでしょうか？
コントロールパネルにあるのなら、タスクバー右クリック[プロパティ]の「タスクバーとスタートメニューのプロパティ」画面のスタートメニューのカスタマイズからスタートメニューに表示出来ます。

回答ありがとうございます。
コントロールパネルに「管理ツール」のアイコンはありますが、ダブルクリックすると何も動きません。スタートアップに「管理ツール」はあります。本来なら「管理ツール」を選択すると、さらにサブメニューになり機能が色々表示されるのですが、なしと表示されます。
何故でしょうか。

チャブーンです。

手順的には誤りはありません。Windows NT 4.0 からアップグレードした場合、(ローカル) ユーザープロファイルパスが %systemroot%\profiles となったままになりますので、スタートメニューのショートカットがうまく作成できないのでしょう。

＃私も覚えがあります

まずは mmc /a コマンドで、スナップインの追加と削除を実行し、必要な管理ツールが "普通に使える" ことを確認してみてください。

あとは、スタートメニュー配下に必要なショートカットを作成すれば、使い勝手の問題も解消すると思います。

念のため、イベントログで何か問題が発生していないか、確認することも忘れずに。

回答ありがとうございます。
mmc /a コマンドで、スナップインの追加と削除を実行? すいません。何をして良いかわかりませんので教えて下さい。
コマンドプロンプトで、mmc /a と入力するのでしょうか?

チャブーンです。

> mmc /a コマンドで、スナップインの追加と削除を実行?
> すいません。何をして良いかわかりませんので教えて下さい。

スタートメニューの [ファイル名を指定して実行(R)] で mmc /a と入力実行すると、MMC スナップイン (コンソールルートと表示されます) が表示されますので 、メニューバーの [ファイル(F)] - [スナップインの追加と削除(M)] - [追加(D)] から管理ツールのスナップインを追加します。たとえば "Active Directory ユーザーとコンピュータ" "Active Directory サイトとサービス" "Active Directory ドメインと信頼関係" 、あるいは "DNS" などがそれにあたります。

わりとわかりやすい画面例としては、たとえばしたのものになります。

http://www.windows-world.jp/faq/-/14205.html

MMC スナップインで管理ツールが使える様になりました。ありがとうございました。