カウンタログ作成時、もしくは作成後にプロパティを表示し、[スケジュール]タブでログの停止を「手動」にせずに「指定時間」あるいは「時刻」に設定してみてはどうでしょうか。

ありがとうございました。
早速試してみます．．．

Windows 2000 Serverのですが下記にあります。
【Windows 2000のパフォーマンス・ログ収集をコマンドから制御して運用を自動化したい】
http://www.monyo.com/technical/windows/37.html

以下、抜粋すると
>再起動するとログの収集が継続されない
ただし、ここで設定を行なっても、マシンの再起動を行なってしまうと、ログの収集が継続されません。再起動後に自動的にログの収集を開始させるには、「Performance Logs and Alerts」サービスの起動を「自動」に設定した上で、図1の「スケジュール」タブの画面で、ログの停止をデ
フォルトの「手動」以外にしておく必要があります。「手動」のままだと再起動後にログの収集が継続されませんので注意してください。

　

ありがとうございました。
勉強になりました．．．